Si virusi i orizit u përhap në të gjithë Afrikën

Një studim i ri përcjell evoluimin e virusit të panachurës së verdhë të orizit dhe shpjegon se si tregtia, shkëmbimet e fara dhe madje Lufta e Parë Botërore i kanë lejuar atij të përhapet në të gjithë kontinentin afrikan.

Virusi i panachurës së verdhë të orizit është një kërcënim i madh për prodhimin e orizit në Afrikë. Kjo sëmundje, e pranishme në më shumë se 25 vende, mund të shkaktojë ndërmjet 20 % dhe 80 % të humbjeve të rendimentit sipas epidemive. Rrëfimi i historisë së shpërndarjes së virusit në Afrikë ndihmon për të kuptuar shkaqet dhe mënyrat e shfaqjes së sëmundjes, ndihmon në vendosjen e strategjive të kontrollit dhe kontribuon në vlerësimin e rrezikut të përhapjes në rajone të tjera të botës. Përmes një qasjeje multidisiplinare që përfshin të dhëna epidemiologjike, virologjike, bujqësore dhe historike, kemi eksploruar lidhjet midis historisë së kultivimit të orizit në Afrikën e Juglindjes dhe përhapjes së këtij virusi në shkallë të gjerë që nga mesi i dytë i shekullit XIX. Këto punime mbi RYMV (akronimi i emrit të tij në anglisht: Rice yellow mottle virus) janë botuar së fundmi në revistën shkencore PLoS Pathogens.

Bëhet fjalë për përfundimin e një pune të gjatë të bazuar në grumbullimin e letrave simptomatike në terren, herë herë të vështira për t'u arritur, të kryera nga disa ekipe virologësh, bashkëautorë të këtij artikulli. Zbulimi i virusit përmes diagnostikimit imunologjik në laborator dhe pastaj karakterizimi i tij përmes sekuestrimit kanë çuar në një koleksion përfaqësues prej 50 gjeneve të plota dhe 335 sekvenceve të gjeneve të kapsidit viral (koka proteike që mbron gjenomin) të marra midis 1966 dhe 2020 në dy milionë kilometra katrorë (Burundi, Etiopi, Kenia, Malawi, Uganda, Republika e Kongo, Ruanda, Tanzani). Një pjesë e mostrave këto janë karakterizuar më parë dhe janë ruajtur në herbarium dhe frigoriferë. Është një bashkëpunim ndërkombëtar shumëpalësh i bazuar në ndarjen e të gjitha rezultateve që ka çuar në këtë studim global të filodinamike së RYMV-së, domethënë shpërndarjes dhe evoluimit të linjave të ndryshme gjenetike virale. Qasjet bio-informative të përdorura për të analizuar dhe vizualizuar rezultatet kanë kërkuar zhvillime metodologjike të zhvilluara nga disa bashkëautorë ekspertë të këtyre disiplinave, dhe të cilat janë të përshtatshme për çdo lloj virusi. Rezultatet e arritura me sekvensat virale të pjesshme ose të plota konvergojnë drejt një skenari të njëjtë. Është duke integruar njohuritë e agronomëve dhe historianëve, të cilët janë gjithashtu bashkëautorë të këtij artikulli, që kemi mundur të interpretojmë këtë « rikthim në kohë ».

Një mënyrë shumë e veçantë e transmetimit viral

Shumë viruse të bimëve transmetohen ekskluzivisht nga insektet e quajtura pikues-sugjerues si pëlqimet, të cilat duke u ushqyer në një bimë të sëmurë, fitojnë virusin dhe më pas e injektojnë në bimë të shëndetshme. RYMV, ndërkohë, transmetohet nga shumë mënyra:

• falë ndërhyrjes së kollëpotrave, insekte të thyer që nuk kanë sistem injeksioni të pështymës por që mund të kontaminohen mekanikisht duke u ushqyer dhe që lëvizin në afërsi të shkurtër;

• nga lopët që duke grahitur në fushat e orizit prodhojnë jashtëqitje në të cilat mbetet i infektueshëm virusi;

• në mënyrë pasive përmes kontaktit me gjethet ose rrënjët e bimëve të infektuara ku ai shumohen shumë.

Këto mënyra të ndryshme të transmetimit dhe përhapjes së RYMV-së nuk janë efikase për transmetim në distanca të gjata. Megjithatë, virusi është i pranishëm në të gjithë kontinentin afrikan. Ky është ky paradoks që ne kemi kërkuar ta zgjidhim.

Një histori e ndërlikuar

Le RYMV u shfaq në mes të shekullit të XIX^e në Malet Eastern Arc në Tanzani, ku praktikohej kultura e orizit në mënyrë të djegies. Disa infeksione të orizit të kultivuar nga barërat e egra të infektuara ndodhën, duke çuar në shfaqjen e tre linjave S4, S5 dhe S6 të virusit. Më pas, RYMV u fut shpejt në luginën e madhe të orizit pranë Kilombero dhe në rajonin e Morogoro. Farat e korrura, edhe pse të papërfunduara nga virusi, janë të kontaminuara nga mbeturina të bimëve, të cilat janë të infektuara vetë, të cilat mbeten në qeset e orizit pas grumbullimit dhe pastrimit të orizit. RYMV, shumë i qëndrueshëm, është në gjendje të mbijetojë kështu për disa vite. Shpërndarja në distanca të gjata e RYMV në Afrikën Lindore u shënua nga tre ngjarje kryesore, të përshtatura me: hyrjen e orizit përgjatë rrugëve tregtare karavani të brigjeve të Oqeanit Indian drejt Liqenit Viktoria në gjysmën e dytë të shekullit të XIX^e (I), me shkëmbimet e farërave nga Liqeni Viktoria drejt veriut të Etiopisë në gjysmën e dytë të shekullit të XX^e (II) dhe, në mënyrë të papritur, me transportin e orizit në fund të Luftës së Parë Botërore si ushqim bazë për trupat, nga lugina e Kilomberos drejt jugut të Liqenit Malawi (III). Shkëmbimet e farërave gjithashtu shpjegojnë shpërndarjen e virusit nga Afrika Lindore drejt Afrikës Perëndimore në fund të shekullit të XIX^e, dhe drejt Madagaskarit në fund të shekullit të XX^e. Në përgjithësi, shpërndarja e RYMV është e lidhur me një gamë të gjerë aktivitetesh njerëzore, disa të papritura. Prandaj, RYMV, edhe pse jo i transmetuar drejtpërdrejt nga farërat ose nga insektet e transportit shumë të lëvizshëm si shumë viruse të bimëve, ka një kapacitet të madh për përhapje. Parametrat e tij të shpërndarjes, të vlerësuar nga rindërtimet tona të quajtura filogjeografike, janë të ngjashëm me ata të viruseve zoonotik shumë të lëvizshëm, viruse që infektojnë kafshët dhe mund të shkaktojnë epidemi te njeriu si rriqeritja.

Duke krahasuar shpërndarjen e tre linjave kryesore të pranishme në Afrikën Lindore falë veglave të reja bio-informative të zhvilluara në këtë studim, kemi vërejtur dinamikë virale shumë të ndryshme. Linja S4 ka pasur suksesin më të madh epidemiologjik me një përhapje të hershme, të shpejtë dhe të përgjithshme. Ajo u zbulua në jug të Liqenit Viktoria në gjysmën e dytë të shekullit XIX dhe më pas qarkulloi rreth Liqenit Viktoria para se të shpërndahej drejt veriut në Etiopi, pastaj drejt jugut në Malawi dhe së fundi drejt perëndimit në Republikën e Kongos, Ruanda dhe Burundi. Linja S6, përkundrazi, mbeti e kufizuar në Luginën e Kilombero dhe në rajonin e Morogoros për disa dekada. Vetëm gjatë dekadave të fundit, ajo u përhap drejt lindjes së Tanzanisë, jug-perëndimit të Kenias dhe ishujve të Zanzibarit dhe Pemba. Në mënyrë të pashpjegueshme, linja S5 mbeti e kufizuar në Luginën e Kilombero dhe në rajonin e Morogoros. Gjatë dekadave të fundit, vërehet një ngadalësim i normave të shpërndarjes së shumicës së shënjave virale që rrjedhin nga linjat S4 dhe S6 të cilat ende nuk i kemi shpjeguar.

Në përfundim, studimi ynë shumëpalësh dhe multidisiplinar evidenton rëndësinë e transmetimit njerëzor të agjentëve patogjenë të bimëve dhe thekson rrezikun e transmetimit të RYMV-së, si dhe të të tjerëve phytovirusë të Afrikës, drejt kontinenteve të tjera. Tani studjojmë shpërndarjen dhe evolucionin e RYMV-së në Afrikën Perëndimore, veçanërisht të linjave virale veçanërisht shqetësuese sepse janë në gjendje të shumohen në varietete të orizit, të konsideruara rezistente ndaj virusit, duke komprometuar kështu strategjitë e kontrollit.